Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC160A6NGH7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms