Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX2A2RU54 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms