Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms