Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms