Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms