Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAPRE3Q9UPY8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms