Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM5BQ9UGL1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms