Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC180Q9P1Z9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms