Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HCN3Q9P1Z3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms