Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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