Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RDH8Q9NYR8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH8Q9NYR8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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