Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms