Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCCC2Q9HCC0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms