Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NXF3Q9H4D5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms