Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms