Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC4A5Q9BY07 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A5Q9BY07 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms