Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SALL3Q9BXA9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms