Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms