Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF607Q96SK3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms