Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX27Q96L92 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX27Q96L92 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms