Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP47Q96K76 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP47Q96K76 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms