Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCORQ96JN0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms