Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms