Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTTNBP2Q8WZ74 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms