Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms