Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms