Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms