Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI1

PKHD1L1, Fibrocystin-L, humanhuman

Predictions only

Length 4,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1Q86WI1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKHD1L1Q86WI1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PKHD1L1Q86WI1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PKHD1L1Q86WI1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PKHD1L1Q86WI1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PKHD1L1Q86WI1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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