Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTF1AQ7RTS3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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