Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms