Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms