Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSSK4Q6SA08 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms