Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM78BQ5VT40 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms