Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms