Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED5Q49AG3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms