Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms