Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM187BQ17R55 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms