Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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