Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIF1AQ16665 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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