Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NRF1Q16656 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NRF1Q16656 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NRF1Q16656 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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NRF1Q16656 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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NRF1Q16656 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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NRF1Q16656 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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NRF1Q16656 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRF1Q16656 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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