Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK5Q16478 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK5Q16478 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK5Q16478 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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