Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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