Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC6Q16204 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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