Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms