Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms