Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RABEP1Q15276 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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