Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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