Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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