Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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