Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RASGRF1Q13972 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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